戸田神父は、山梨県東山梨郡の寒村出身。
旧制日川中（同県）を中退し、開成中（東京都）に入学。
１７歳でカトリックの洗礼を受け、ローマへ留学。
１９４１年に札幌教区長に着任した。
開戦後の４２年３月、「米英を相手に戦争したら、どうなるかわからない」と同僚の神父に言ったとして、旧軍刑法違反で逮捕された。
裁判では無罪になったが、特高警察による監視は続いたという。
４４年には横浜教区長に転任。
しかし、終戦３日後の４５年８月１８日、横浜市の保土ヶ谷教会内で何者かに頭を撃たれ、血まみれの死体で発見された。
戸田神父は殺害される２日前、単身で軍に出向き、接収された教会などの返還を求めていた。
その際、軍から激しい怒りを買った、そうした経緯と目撃情報や遺留品などから、憲兵が戸田神父を射殺したと見られている。
しかし、事件は未解決のままだ。